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ICS 11.220 B 41 中华人民共和国国家标准 GB/T 34756—2017 猪轮状病毒病 病毒RT-PCR检测方法 Porcine rotavirus diseaseRT-PCR for detecting virus acid 2018-05-01实施 2017-11-01发布 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 发布 中国国家标准化管理委员会 GB/T 34756—2017 前言 本标准按照GB/T1.12009给出的规则起草。 本标准由中华人民共和国农业部提出 本标准由全国动物卫生标准化技术委员会(SAT/TC181)归口。 本标准起草单位:东北农业大学、中国动物卫生与流行病学中心、河南牧业经济学院 本标准起草人:乔薪瑷、邵卫星、魏荣、崔文、唐丽杰、李一经、姜艳平、孙映雪、李卫华、徐耀辉。 GB/T 34756—2017 猪轮状病毒病 病毒RT-PCR检测方法 1范围 本标准规定了猪轮状病毒RT-PCR检测方法的试剂、仪器设备、操作程序。 本标准适用于猪临床样品(新鲜粪便和小肠)及细胞培养物中猪轮状病毒核酸的检测。 2 2缩略语 下列缩略语适用于本文件。 AMV.鸟类RNA病毒反转录酶(avianmyeloblastosisvirus) bp:碱基对(basepair) DEPC:焦碳酸二乙酯(diethypyrocarbonate) DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid) dNTPs:脱氧核糖核苷三磷酸(deoxyribonucleosidetriphosphates) PBS:磷酸盐缓冲液(phosphate-bufferedsalinebuffer) PCR:聚合酶链式反应(polymerasechainreaction) RNA:核糖核酸(ribonucleic acid) RRI:RNA酶抑制剂(RNase ribonucleaseinhibitor) RT:反转录(reverse transcriptase) RT-PCR:反转录-聚合酶链式反应(reversetranscriptase-polymerasechainreaction) Taq酶:Taq DNA聚合酶(Taq DNApolymerase) 3 3试剂 除另有规定外,所用试剂应为分析纯。提取病毒RNA所用试剂应使用无RNA酶的容器进行 分装。 3.1氯仿:常温保存。 3.2 2异丙醇。 3.3 75%乙醇。 3.4 二乙基焦磷酰胺(DEPC)。 3.5 Taq酶。 3.6 AMV. 3.7 DNA分子量标准(DL2000bp)。 3.8 电泳缓冲液(TAE)(配制见A.1)。 3.9 1.5%琼脂糖(配制见A.3)。 3.10 猪轮状病毒阳性样品及阴性样品(见附录B)。 4仪器设备 4.1 高速冷冻离心机 1 GB/T 34756—2017 4.2 2PCR扩增仪。 4.3 核酸电泳系统。 4.4恒温水浴锅。 4.5冰箱(2℃~8℃、-20℃)。 4.6凝胶成像系统(或紫外透射仪)。 4.7 组织匀浆器或研钵。 4.8 3二级生物安全柜。 4.9 微量加样器(0.5μL~10μL;2μL~20μL;20μL~200μL;100μL~1000μL)。 5操作程序 5.1样品的采集、运输和处理 5.1.1样品采集和运输 采集腹泻急性期的小肠(5.0cm~10.0cm)或新鲜粪便(5.0g~10.0g),放到密封袋中,置于带有冰 袋的保存箱中,送至实验室。样品被运到实验室时,附带的冰袋应未完全融化;如样品不能被及时送到 实验室,应置于一20℃冰箱中保存,贮存要求不超过1个月;如需长期保存样品,应置于一80℃冰箱。 5.1.2样品处理 5.1.2.1小肠样品 取5.0cm~10.0cm小肠组织,用剪刀剪碎,加人10mLPBS,用适宜规格的组织研磨器或研钵研磨 后转移到适宜玻璃瓶中,每毫升样品加入RNA酶抑制剂RRI(40U/L)500uL,一20℃反复冻融3次 5.1.2.2粪便样品 取0.5g~1.0g新鲜粪便,加人到含5.0mL~10.0mL样品处理液(配方见A.2)的玻璃瓶中,每毫 升样品加人RNA酶抑制剂RRI(40U/μL)500uL,一20℃反复冻融3次后,摇匀,取1.0mL到1.5mL 离心管中,经12000r/min离心5min,取500μL上清液备用。 5.1.2.3细胞培养物样品 2000r/min离心10min,取1mL上清备用。 5.2RNA的提取 可选择市售商品化试剂盒、全自动核酸提取法或其他商品化提取法提取RNA。在提取RNA过程 中设立阳性和阴性对照样品,RNA提取操作应在生物安全柜内进行。 5.3反转录 5.3.1反转录引物序列 反转录引物采用下游引物P2,见附录C。 5.3.2反转录反应体系 反转录的反应体系见附录D。 2
GB-T 34756-2017 猪轮状病毒病 病毒RT-PCR检测方法
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