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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210622304.6 (22)申请日 2022.06.02 (71)申请人 江苏省家禽科 学研究所 地址 225200 江苏省扬州市邗江区仓颉路 58号 (72)发明人 施寿荣 邵丹 童海兵 胡艳 肖蕴祺 沈一茹 张珊 王强 张安 陈静龙 (74)专利代理 机构 上海智信专利代理有限公司 31002 专利代理师 王洁 郑暄 (51)Int.Cl. C12Q 1/6888(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 与鸡高温 耐受相关的分子标记及其应用 (57)摘要 本发明涉及一种与鸡高温耐受相关的SNP分 子标记, 所述的SNP分子标记位点对应于NCBI上 鸡的参考基因组(Gallus Gallus 5.0)第9号染 色体正义链第23059382位、 23062420位、 23062522位, 且所述的3处位点处的碱基分别是G 或A、 C或T、 G或A。 利用本发明的与鸡高温耐受相 关的3个SNP分子标记进行辅助选 择, 快速而准确 地获得遗传进展; 且本发明同时提供了 该3个SNP 分子标记的序列和引物, 可建立快速高效精准的 分子标记辅助育种选择技术, 加快高温耐受鸡品 系的选育工作。 权利要求书1页 说明书5页 序列表3页 附图5页 CN 114921570 A 2022.08.19 CN 114921570 A 1.一种与鸡高温耐受相关的SNP分子标记, 其特征在于, 所述的SNP分子标记位点对应 于NCBI上鸡的参考基因组(Gallus Gallus 5.0)第9号染色体正义链第23059382位、 23062420位、 23 062522位, 且所述的3处位 点处的碱基分别是G或A、 C或T、 G或A。 2.根据权利 要求1所述的SNP分子标记, 其特征在于, 所述的SNP分子标记的核苷酸序列 如SEQ ID NO.7所示且第126位碱基是G或A。 3.根据权利 要求1所述的SNP分子标记, 其特征在于, 所述的SNP分子标记的核苷酸序列 如SEQ ID NO.8所示且第120位碱基是C或T。 4.根据权利 要求1所述的SNP分子标记, 其特征在于, 所述的SNP分子标记的核苷酸序列 如SEQ ID NO.9所示且第96位碱基是C或T。 5.一种根据权利要求1所述的SNP分子标记 的引物组合, 其特征在于, 所述的引物组合 由具有SEQ ID NO.1、 SEQ ID NO.3、 SEQ ID NO.5所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQ ID NO.2、 SEQ ID NO.4、 SEQ ID NO.6所示核苷酸序列的下游引物组成。 6.一种选 育高温耐受的鸡的方法, 其特 征在于, 包括以下步骤: (1)检测一定样本数量的基因组DNA中如权利要求1或权利要求2~4所述的SNP分子标 记位点的基因型; (2)基于SNP位点的基因型对高温耐受鸡进行选择, 选择基因型满足3个位点分别为GG、 CC、 GG鸡, 淘汰其 他基因型的鸡。 7.根据权利要求6所述的选育高温耐受的鸡的方法, 其特征在于, 所述的步骤(1)利用 所述的引物组合检测三个SNP分子标记的基因型。 8.根据权利要求6所述的选育高温耐受的鸡的方法, 其特征在于, 所述的步骤(1)中样 本数量为100至1000只。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114921570 A 2与鸡高温耐受相关的分子标记及其应用 技术领域 [0001]本发明涉及基 因工程和遗传育种领域, 具体涉及 一种与鸡高温耐受相关的分子标 记及其应用。 背景技术 [0002]在过去几十年里, 全球变暖已造成许多地区高温季节时间延长, 集约化养殖环境 下高温胁迫对家禽健康的影响越来越大。 由于禽类体表羽毛丰厚, 且全身无汗腺, 代谢旺 盛, 体温高, 现代商业家禽由于其快速的新陈代谢会产生更多的体温, 使得家 禽遭受高温时 尤为敏感, 轻者生长速度慢, 重者导致死亡高温, 对家禽养殖业造成巨大的经济损失。 据 统 计, 高温对全球家禽行业造成的经济损失每年高达1.28亿至1.65亿美元。 那么如 何保证家 禽在高温环境下具有较高的生产性能和经济效益, 是目前家禽养殖比较关注的焦点问题。 当前家禽生产中也在不断开展有效的缓解之策, 包括采用通风降温、 营养调控等措施来应 对高温环境下的不适应, 其中通过育种手段开发 高温耐受家 禽品系亦可成为有效且长久的 举措之一。 [0003]国家科技部重点研发计划申报指南提出 “聚焦加快破解农业生物遗传基础科学问 题, 提升设计育种能力, 保障国家粮食安全 ”的目标, 并首次将农业生物重要性状与环境适 应性的研究要点作为指南内容之一, 凸显了 国家对生物与环境适应的高度重视。 而家禽育 种的主要目的就是为了提高家禽的生产性能, 然而家禽生产性能的提高必然需要对环境适 应能力的提高, 尤其是对未来高温环境能有更好的适应性。 因而高温耐受被认为是是家禽 的一种环境适应能力, 通过遗传育种手段培育高温耐受品系 是当代家禽育种的方向之一。 利用有效的分子标记进行高温耐受的选择, 能够有效促进鸡高温耐受品种或品系的培育。 目前仅有少数研究报道了可作为鸡高温耐受的潜在遗传标记, 主要集中在已知的基因开展 工作, 对于鸡基因组上更多潜在的分子标记研究尚缺乏。 因此定位高温耐受的SNP分子标记 可获得更快的遗传进 展, 对推动高温 耐受鸡新品系培 育的进程具有重要的意 义。 发明内容 [0004]为了解决生产中高温耐受新品系的选育问题, 本发明提供了一种与高温耐受相关 的SNP分子遗传标记, 所述的SNP标记有助于从遗传水平上改善家禽的高温耐受性, 可用于 鸡的分子标记辅助选择。 [0005]为达到上述发明的目的, 本发明所采用的技 术方案如下: [0006]本发明第一方面提供了一种与鸡高温耐受相关的S NP分子标记, 所述的S NP分子标 记位点对应于NCBI上鸡的参考基因组(Gallus Gallus 5.0)第9号染色体正义链第 23059382位、 23 062420位、 23 062522位, 且所述的3处位 点处的碱基分别是G或A、 C或T、 G或A。 [0007]较佳地, 所述的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示且第126位碱基是G 或A。 [0008]较佳地, 所述的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示且第120位碱基是C说 明 书 1/5 页 3 CN 114921570 A 3
专利 与鸡高温耐受相关的分子标记及其应用
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