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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210875336.7 (22)申请日 2022.07.22 (71)申请人 北京阅微基因技 术股份有限公司 地址 100037 北京市海淀区三里河路39号 院10号楼6F (72)发明人 张奇 徐朝阳 胡欢 陈初光 (51)Int.Cl. C12Q 1/6883(2018.01) C12Q 1/6858(2018.01) C12N 15/11(2006.01) (54)发明名称 一种NOTCH2NLC基因CGG重复数检测体系及 试剂盒 (57)摘要 本申请属于分子诊断技术领域, 具体涉及一 种对神经元核内包涵体病相关NOTCH2NLC基因 CGG单元重复数量检测的体系及其试剂盒, 该体 系能够根据检测得到的全长产物大小和CGG重复 单元扩增产物片段大小的结果对CGG重复单元数 量作出准确的判断, 从而更加特异、 灵敏、 稳定、 快速的鉴定神经元核内包涵体病(NIID), 并 区别 于其他相关神经性疾病。 权利要求书2页 说明书12页 附图8页 CN 115029434 A 2022.09.09 CN 115029434 A 1.一种用于扩增检测NOTCH2NLC基因5'非翻 译区域CGG重 复区域的CGG重复数的引物组 合, 其特征在于, 所述的引物组合包 含如下引物: 1)上/下游引物: 与NOTC H2NLC基因CG G单元重复区域上 下游序列特异性结合; 2)重复引物: 与NOTCH2NLC基因5 ’端3‑5个“CGG”重复基因以及 4‑7bp的重复区域边 界序 列互补, 同时引物5 ’端连接通用引物序列; 3)通用引物: 非人源化序列, 交叉测试不干扰反应 体系的扩增。 2.权利要求1所述的引物组合, 其特 征在于, 1)所述上/下游引物, 序列如SEQ ID NO.5‑13任一所示; 2)所述重复引物, 序列如SEQ ID NO.15‑26任一所示; 3)所述通用引物, 序列如SEQ ID NO.27‑28任一所示; 优选的, 1)所述上/下游引物仅为下游引物, 序列如SEQ ID NO.11‑13任一所示; 2)所述重复引物, 序列如SEQ ID NO.18、 21、 25、 26任一所示; 3)所述通用引物, 序列如SEQ ID NO.27、 28任一所示。 3.权利要求2所述的引物组合, 其特 征在于, 所述引物组合具体为: 所述1)上/下游引物为下游引物, 序列如SEQ ID NO.12所示; 所述2)重复引物: 序列如SEQ ID NO.18或21任一所示; 所述3)通用引物: 序列如SEQ ID NO.27所示; 或, 所述1)上/下游引物为下游引物, 序列如SEQ ID NO.12所示; 所述2)重复引物: 序列如SEQ ID NO.25或26任一所示; 所述3)通用引物: 序列如SEQ ID NO.28所示。 4.权利要求3所述的引物组合, 其特征在于, 所述引物组合 中, 还包含位于NOTCH2NLC基 因5'非翻译区域CGG重复区域5 ’端的上游引物和3 ’端的下游引物的全长引物组合, 所述全 长引物序列包括: 全长上游引物, 序列如SEQ ID NO.4所示, 全长下游引物, 序列如SEQ ID NO.11‑13所示; 优选的: 全长上游引物, 序列如SEQ ID NO.4所示, 全长下游引物, 序列如SEQ ID NO.12所示。 5.根据权利要求1 ‑4任一所述的引物组合, 其特征在于, 所述下游引物进一步包括荧光 基团修饰和/或硫代磷酸 化修饰。 6.一种扩增检测NOTCH2NLC基因5'非翻 译区域CGG重复区域的CGG重 复数的检测体系或 试剂盒, 其特 征在于, 包 含权利要求1 ‑5任一所述的引物组合。 7.权利要求6所述的检测体系或试剂盒, 其特征在于, 还包含酶混合液、 PCR扩增缓冲 液、 内标、 无核酸酶纯 水和质控品DNA。 8.权利要求1 ‑5任一所述引物组合在制备扩增检测NOTCH2NLC基因5'非翻 译区域CGG重 复区域的CG G重复数的检测体系或检测试剂盒中的应用。 9.根据权利要求8所述的应用, 其特征在于, 所述检测体系或检测试剂 盒中结果计算采权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 115029434 A 2用公式如下: 全长体系: 重复体系: 其中, FLsize是标注的全长峰的大小, RPsize是标注的重复峰的大小, RP1st是重复体系第 一根峰的片段 大小。 10.一种扩增检测NOTCH2NLC基因5'非翻 译区域(UTR)CGG重复区域的CGG重复数的检测 方法, 其特征在于, 包含利用权利要求 1‑5任一所述引物组合, 或权利要求6 ‑7任一所述试剂 盒进行扩增检测的步骤; 优选的, 通过如下公式计算重复数: 全长体系: 重复体系: 其中, FLsize是标注的全长峰的大小, RPsize是标注的重复峰的大小, RP1st是重复体系第 一根峰的片段 大小。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 115029434 A 3
专利 一种NOTCH2NLC基因CGG重复数检测体系及试剂盒
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