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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210617602.6 (22)申请日 2022.06.01 (71)申请人 安徽省农业科 学院畜牧兽医研究所 地址 230000 安徽省合肥市农科南路40号 (72)发明人 王洁茹 殷冬冬 戴银 尹磊 刘林清 潘孝成 王重龙 沈学怀 胡晓苗 侯宏艳 赵瑞宏 周学利 (74)专利代理 机构 合肥东邦滋原 专利代理事务 所(普通合伙) 3415 5 专利代理师 王天马 (51)Int.Cl. C12N 15/11(2006.01) C12Q 1/70(2006.01) C12Q 1/6844(2018.01) C12N 15/113(2010.01)C12R 1/93(2006.01) (54)发明名称 RPA引物对及其应用、 可视化检测PCV4的试 剂盒及其应用和检测PCV4方法 (57)摘要 本发明属于猪圆环病毒4型核酸的可视化检 测领域, 具体涉及RPA引物对及其应用、 可视化检 测PCV4的试剂盒及其应用和可视化检测PCV4的 方法; 所述RPA引物对是由RPA F和RPA R组成的 引物对, 其中, 所述RPA F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示, 所述RPA R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。 本发明提供的试剂盒具有特异性良好 且检测限低的优点, 能够快速定性检测PC V4。 且 本发明试剂盒判读方法直观, 且与其他家禽病毒 没有交叉反应。 可实现PCV4的高灵敏度、 高特异 性检测。 可对猪圆环病毒4型的早期检测及后期 流行病学调查提供了技术支 撑, 对该病的防控具 有指导意义。 权利要求书1页 说明书5页 序列表1页 附图3页 CN 115141826 A 2022.10.04 CN 115141826 A 1.一种RPA引物对, 其特征在于: 所述RPA引物对是由RPA F和RPA R组成的引物对, 其 中, 所述RPA F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示, 所述RPA R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2 所示。 2.权利要求1所述的RPA引物对在制备检测或诊断可视化PCV4中的应用。 3.一种可视化检测PCV4的试剂盒, 其特征在于: 所述的试剂盒包含: RPA引 物对、 crRNA 引导序列和目标DNA片段; 所述RPA引物对为权利要求1所述的RPA引物对。 4.根据权利要求3所述的可视化检测PCV4的试剂盒, 其特征在于: 所述crRNA引导序列 的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。 5.根据权利要求3所述的可视化检测PCV4的试剂盒, 其特征在于: 所述目标DNA片段通 过所述RPA引物对 扩增目的基因 组DNA而获得。 6.根据权利要求5所述的可视化检测PCV4的试剂盒, 其特征在于: 所述目标DNA片段为 PCV4的Cap基因的扩增序列; 所述Cap基因的扩增序列如SEQ ID No.4。 7.根据权利要求3所述的可视化检测PCV4的试剂盒, 其特征在于: 所述试剂盒还含有 Cas13a蛋白、 NTP buffer mix、 T7 RNA polymerase mix、 RNase inhibitor、 RNA Reporter、 PCV4质粒 标准品、 猪圆环病毒4型质粒 标准品和横向流动试纸条中的至少一个。 8.根据权利要求7中任意一项所述的可视化检测PCV4的试剂盒, 其特征在于: 所述 Cas13a蛋白为LwCas13a核酸酶。 9.权利要3 ‑8中任意一项所述的试剂盒在制备检测或诊断可视化检测PCV4中的应用。 10.一种可视化检测PCV4的方法, 其特 征在于: 所述方法包括: A、 从待测组织或血清样本中获得PCV4基因 组DNA; B、 以PCV4基因组DNA为打靶位点, 按照重组酶聚合酶扩增技术RPA的设计原则设计RPA 扩增引物, 并通过RPA等温扩增技 术扩增PCV4基因 组DNA, 得到待检测的PCV4基因 组DNA; C、 将待检测的PCV4基因组DNA与权利要3 ‑8中任意一项所述的试剂盒里提供的试剂按 体系混合并孵育; 利用横向流动试纸条稀释液将检测产物稀释后, 加载到横向流动试纸条 上, 放置3‑5分钟, 根据显色条 带进行结果判定 。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 115141826 A 2RPA引物对及其应用、 可视化检测PCV4的试剂盒及其应用和检 测PCV4方 法 技术领域 [0001]本发明属于猪圆环病毒4型核酸的可视化检测领域, 具体地说, 本发明涉及 猪圆环 病毒4型核酸的检测, 尤其涉及RPA引物对及其应用、 可视化检测 PCV4的试剂盒及其应用和 可视化检测PCV4的方法。 背景技术 [0002]猪圆环病毒(PCV)是一种无囊膜的环状DNA病毒, 属于圆环病毒科、 圆环病毒属。 分 为四种血清型(PCV1 ‑4)。 PCV4可引起猪呼吸道疾病综合征、 猪 皮炎和肾病综合征、 心肌炎和 母猪繁殖障碍等疾病。 PCV4临床上常与其它病毒混合感染, 导致患病猪死亡率显著增高 (25%‑40%), 为了预防疾病的传出和控制病毒的传播, 精准 监测极为重要。 [0003]准确、 快速的检测是减少其传播扩散的重要手段。 目前, 对于PCV4的检验通常采用 病毒分离鉴定、 常规PCR, 荧光定量PCR等。 普通PCR检测时间长, 病毒分离鉴定、 荧光定量P CR 等需要专业的设备和技术人员。 基于CRISP R ‑Cas13a系统结合可视化试纸条的检测方法, 以其高灵敏度, 高特异性且适应现场快速检测, 准确检测的需要, 为流行病学 的调查, 掌握 传播规律以及疫病的诊断和防控提供有力支持。 发明内容 [0004]本发明的目的是针对现有技术存在的PCV4检测时间长、 专业性高以及灵敏度低的 不足, 提供了RPA引物对及其应用、 可视化检测PCV4的试剂盒及其应用和可视化检测PCV 4的 方法, 该方法具有灵敏度高、 特异性强、 操作简便、 检测时间短, 结果可肉眼观察的优点, 弥 补了常规检测方法的不足, 对于圆环病毒的防控和治疗有很好的实用价 值。 [0005]为实现上述目的, 本 发明第一方面提供一种RPA引物对, 所述RPA引物对是由RPA F 和RPA R组成的引物对, 其中, 所述RPA F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示, 所述RPA R的核 苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。 [0006]本发明第二方面 提供所述的RPA引物对在制备检测或诊断可视化PCV4中的应用。 [0007]本发明第三方面提供一种可视化检测PCV4的试剂盒, 所述 的试剂盒包含: RPA引 物对、 crRNA引导序列和目标DNA片段; 所述RPA引物对为权利要求 1所述的RPA引物对。 [0008]优选地, 所述crRNA引导序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。 [0009]优选地, 所述目标DNA片段通过 所述RPA引物对 扩增目的基因 组DNA而获得。 [0010]优选地, 所述 目标DNA片段为PCV4的Cap基因的扩增序列; 所述Cap 基因的扩增序 列如SEQ ID No.4。 [0011]优选地, 所述试剂盒还含有Cas13a蛋白、 NTP buffer mix、 T7 RNA polymerase mix、 RNase inhibitor、 RNA Reporter、 PCV4质粒标准品、 猪圆环病毒 4型质粒标准品和横向 流动试纸条中的至少一个。 [0012]优选地, 所述Cas13a 蛋白为LwCas13a核酸酶。说 明 书 1/5 页 3 CN 115141826 A 3
专利 RPA引物对及其应用、可视化检测PCV4的试剂盒及其应用和检测PCV4方法
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